Protein sel tunggal memiliki kelebihan, antara lain ;
- laju pertumbuhan sangat cepat yaitu dalam ukuran jam dan masih bisa ditingkatkan lagi
- dapat menggunakan bermacam-macam media atau substrat
- produksi PST tidak bergantung iklim dan musim
- memiliki kandungan protein lebih tinggi daripada hewan dan tumbuhan
- Pemilihan dan penyiapan sumber karbon, beberapa perlakuan fisik dan kimiawi terhadap bahan dasar yang diperlukan
- Penyiapan media yang cocok dan mengandung sumber karbon, sumber nitrogen, fosfor, dan unsur-unsur lain yang penting
- Pencegahan kontaminasi media
- Pembiakan mikroorganisme yang diperlukan
- Pemisahan biomassa microbial dari cairan fermentasi
- Penanganan lanjut biomassa